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“國知局于2022年6月10日發(fā)布第四五八號公告,宣布從2022年7月1日起,向國知局提交的國家專利申請和PCT國際申請,包含于序列表的,該序列表電子文件應(yīng)符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)要求?!?/strong>
來源:IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)
作者:鄧旭 北京派特恩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司
一、ST.26的背景
1998年11月,WIPO出臺了《專利申請中核苷酸和氨基酸序列表的表述標(biāo)準(zhǔn)》,這就是WIPO ST.25。然后,國知局于2001年發(fā)布了ZC_0003-2001《核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表電子文件標(biāo)準(zhǔn)》。其結(jié)合我國的一些國情對WIPO ST.25進(jìn)行了一些適當(dāng)?shù)男薷摹?001年11月,國知局公布ZC_0003-2001于2001年11月1日起,正式實施,一直沿用至今。但是,隨著時代的發(fā)展和進(jìn)步,ST.25逐漸暴露出起諸多弊端,特別是電子形式的標(biāo)準(zhǔn)化的深入,ST.25很難用于數(shù)據(jù)交換和自動驗證匹配。
因此,出于對電子形式的需要,以及對序列精確描述和檢索的需要,EPO于2010年向WIPO標(biāo)準(zhǔn)委員會提出了建立一個基于XML格式的生物序列標(biāo)準(zhǔn)ST.26。其目的在于統(tǒng)一全球的標(biāo)準(zhǔn),使得原本25中模糊不清的規(guī)則得到統(tǒng)一,同時能夠提高電子形式的驗證匹配和檢索,最后還能提高序列描述的精確程度。該標(biāo)準(zhǔn)于2010年10月開始由EPO負(fù)責(zé)牽頭起草,2016年3月正式審議通過。這就是WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)的由來。
國知局于2022年6月10日發(fā)布第四五八號公告,宣布從2022年7月1日起,向國知局提交的國家專利申請和PCT國際申請,包含于序列表的,該序列表電子文件應(yīng)符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)要求。因此,距今為止,該標(biāo)準(zhǔn)已經(jīng)實行了一個月左右了,大家也都是處于摸著石頭過河的階段,歡迎各位同行共同討論遇到的問題和解決方法。
二、WIPO Sequence軟件的簡介
與WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)同步發(fā)布的,也就是一款全新的軟件WIPO Sequence。這款軟件據(jù)稱由多國共同開發(fā),因此,基本上各個國家不會在發(fā)布類似之前的PatentIn 3.5或者SIPO Sequence,以后都會統(tǒng)一使用WIPO Sequence,換句話說,這次發(fā)布的WIPO Sequence將會成為生物領(lǐng)域?qū)@韼熞院箝L久打交道的工具。說實話,軟件穩(wěn)定性不佳,筆者在寫這篇文章的時候,頻繁出現(xiàn)項目不能加載的情況:
有些時候重啟電腦可以解決,有些時候重啟電腦仍然無法決絕。至今未能找到錯誤原因。
進(jìn)入正題,首先,這款軟件不是PatentIn,是有中文的,但是很多小伙伴卻發(fā)現(xiàn)每次進(jìn)去了之后都是默認(rèn)為英文,然后都要手動的將它調(diào)成中文,筆者也曾經(jīng)很苦惱這個事情。但實際上它是可以設(shè)置的。咱們首先打開WIPO Sequence,會看到如下的標(biāo)簽欄:
其中,有一個優(yōu)選項,點開它,會跳轉(zhuǎn)到下面這一個頁面:
點擊旁邊筆型圖案就可以進(jìn)行修改啦,將工具界面默認(rèn)語言修改為中文,這樣每次打開之后都是中文了,再也不需要將其手動從英文調(diào)成中文。
接下來,簡單介紹一下上面標(biāo)簽欄的各個標(biāo)簽:
第一個就是“項目”,也就是我們每一件申請需要制作序列表的地方,都在項目這一欄中完成。
第二個是“個人和組織”,可以把它理解成專屬于代理師自己的整理庫,可以把自己經(jīng)常服務(wù)的申請人和發(fā)明人都增加進(jìn)去,這樣每次只需要勾選不需要重新輸入一遍了。
右上角有一個“創(chuàng)建新個人或組織”,點開之后,就可以填寫名稱、語言,和拉丁名稱。名稱正常填寫,語言根據(jù)需要進(jìn)行選擇,國內(nèi)一般選擇中文。
注意雖然此處拉丁名稱沒有標(biāo)星號,沒填寫也可以保存。但實際上,在序列表制作過程中是必須的,不然無法保存申請人。因此,建議此處可以寫申請人和發(fā)明人的英文名,沒有英文名可以寫拼音。
第三個是“生物體”,跟之前的所有軟件一樣,WIPO Sequence也是可以自主添加生物體的,而且在該處添加的生物體,會自動出現(xiàn)在往后所有項目中Organism中。
所以,其實關(guān)于在WIPO Sequence中爭議頗多的“Artificial Sequence”這一選項的消失,很多同行建議用選項中存在的“Synthetic Construct”,即人工構(gòu)建體替代。筆者卻認(rèn)為,可以自主添加Artificial Sequence,然后其在以后的項目中均可以選擇,也不會報錯。而“Synthetic Construct”,即人工構(gòu)建體,筆者的理解其更多是偏向于載體之類的,而常見的核酸引物和探針其實并不屬于人工構(gòu)建體。
第四個是“幫助”,在該標(biāo)簽里面會獲得一些其余的資料,包括軟件的操作手冊,標(biāo)準(zhǔn)ST.26的介紹。前者是有中文的,后者并沒有中文。這個很容易就能在WIPO的官網(wǎng)上找到。
三、序列制作簡介
接下來,筆者簡單的對序列表的制作進(jìn)行介紹。當(dāng)然一些簡單的事項就不贅述了,主要是對一些易錯項和少見情況進(jìn)行簡介。當(dāng)然,筆者也處于摸索之中,難免會出現(xiàn)問題和錯誤,請各位同行諒解。
首先是申請確定,基本上咱們面臨的情況都是沒有申請?zhí)柕臅r候制作的,所以申請人檔案名是必填的,此處可以填一些申請人或代理師自己的案號,檔案名也會體現(xiàn)在項目欄中。
至于如果有申請?zhí)?,那就勾選分配申請?zhí)柡?,然后填寫對?yīng)的號碼和日期就行了。
接下來是申請人和發(fā)明人,如果如筆者所說創(chuàng)建了自己的發(fā)明人,則可以選擇現(xiàn)有發(fā)明人并在下拉菜單中進(jìn)行選擇。
但是需要提醒的是,如果只操作到此處,在最后的驗證過程中會報錯,在保存了發(fā)明人之后,需要代理師手動回去選擇修改,將右下角的“標(biāo)記為主要”打勾并保存。因為,ST.26只允許出現(xiàn)一個申請人,所以,需要將第一申請人標(biāo)記為主要,在最后的格式中也只會出現(xiàn)第一申請人。
再次是發(fā)明名稱,此處并沒有過多的注意事項,填寫對應(yīng)的發(fā)明名稱和語言即可。
最后則是重頭戲,序列。由于ST.26對于序列的各種特征規(guī)定的非常嚴(yán)格,所以在日常的制作中,代理師們需要根據(jù)序列的具體信息添加特征。
點擊創(chuàng)建新序列,則會出現(xiàn)如下方框:
序列名稱、分子類型、殘基大體上都跟之前使用PatentIn差不多,此處的生物體名稱,如果咱們自主創(chuàng)建了人工序列,則此處下拉菜單中就會有“Artificial sequence”這一選項,是可以進(jìn)行選擇的。
需要提醒的是,殘基,也就是輸入序列的地方,不能再像之前使用ST.25一樣可以隨意輸入各種字符了,否則會出現(xiàn)如下提示:
現(xiàn)在核苷酸能使用的字符如下所示:
氨基酸能使用的字符如下所示:
總的來說,除開上述字符,核苷酸一律用n,氨基酸一律用X代替。然后再后續(xù)特征中選擇添加功能,并根據(jù)具體情況進(jìn)行描述。
例如,我們需要創(chuàng)建一段核苷酸序列atciiiatgg ggggg那么,我們輸入的應(yīng)該是atcnnnatggggggg,然后創(chuàng)建序列,并在如下圖所示中選擇添加功能:
選擇添加功能后將會出現(xiàn)如下選項:
我們在特征鍵的下拉菜單中根據(jù)需要選擇modified base,然后再特征位置標(biāo)注4..7,這樣的意思是第4位到第7位為修飾堿基。特征鍵下拉菜單中有多種選項可以選擇,代理師可以根據(jù)序列具體序列信息進(jìn)行選擇。而位置的表述在ST.26中也有明確描述,如下所示:
根據(jù)位置關(guān)系自行選擇輸入模式即可。
在位置和特征鍵均描述完之后,則會出現(xiàn)如下所示的限定符值選擇:
在限定符值的下拉菜單中選擇i,即可,點擊創(chuàng)建特征,就生成了我們想要創(chuàng)建的序列。
這樣一個序列基本上就創(chuàng)建好了。需要提醒的是,如果在限定符值的下拉菜單中并未找到我們想要的類型,則可以選擇OTHER,并在再次彈出的note中,繼續(xù)填寫限定符值,如下所示:
但是,筆者卻至今卡在此處,不知道如何解決該問題。如果是自己自定義的限定符值,按照它的操作,均填寫完畢后會報錯,如下所示:
該錯誤描述的“特征位置”暫時并不清楚其代表的含義。筆者有同事讓我在項目再開始的設(shè)置中設(shè)置非英文自由文本語言代碼,但仍然未解決該問題。
以上就是創(chuàng)建一個序列,特別是含有少見序列信息的序列的方法。當(dāng)然,由于時間較短,筆者也只是簡單的介紹一些知識,遇到更為特殊信息的序列,其處理方法肯定更為復(fù)雜和少見,但是筆者今天所介紹的方法,應(yīng)該足以應(yīng)付95%以上的序列創(chuàng)建。
除此之外,還有一些注意事項需要各位關(guān)注:
1、雖然國知局規(guī)定了在以后的申請中,均只需要遞交XML格式的序列表,而不需要TXT格式的序列表。但是國知局同樣注明了為了方便計算費用,在遞交時,仍然需要遞交PDF版本的序列表,而把XML格式轉(zhuǎn)化成PDF格式是會出現(xiàn)亂碼而且不太美觀,但是WIPO Sequence自帶打印功能,就在項目名稱旁邊有一個打印按鈕,如下圖所示,即可完成打印,截止到目前為止,筆者遞交的國內(nèi)申請,PDF均是遞交的通過這一途徑打印出來的PDF。
2、在驗證過程中,出現(xiàn)警告可以無需理會,仍能生成序列表。但是如果一旦出現(xiàn)錯誤,則無法生成序列表,必須要把錯誤消除,才能生成序列表。
3、新版本序列表中只能出現(xiàn)一個申請人,因此,煩請在填寫申請人材料時,將第一申請人勾選為主要。
(原標(biāo)題:關(guān)于WIPO ST.26 序列表制作的一些tips)
來源:IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)
作者:鄧旭 北京派特恩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司
編輯:IPRdaily王穎 校對:IPRdaily縱橫君
注:原文鏈接: 關(guān)于WIPO ST.26 序列表制作的一些tips (點擊標(biāo)題查看原文)
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