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“智慧芽旗下Bio生物序列數(shù)據(jù)庫于2024年3月21日重磅推出全球首個(gè)序列的化學(xué)修飾檢索功能,在生物信息學(xué)領(lǐng)域再次樹立了新的里程碑?!?br/>
來源:IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)
作為全球領(lǐng)先的生物數(shù)據(jù)資源,智慧芽旗下Bio生物序列數(shù)據(jù)庫(簡(jiǎn)稱"Bio")在生物信息學(xué)領(lǐng)域再次樹立了新的里程碑--于2024年3月21日重磅推出全球首個(gè)序列的化學(xué)修飾檢索功能。這是暨2023年通式檢索創(chuàng)新后再一次創(chuàng)新突破,Bio以其卓越的功能和深度的數(shù)據(jù)覆蓋,不僅在行業(yè)內(nèi)確立了無可匹敵的競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì),更被公認(rèn)為業(yè)界的領(lǐng)航者!
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Bio生物序列數(shù)據(jù)庫化學(xué)修飾檢索功能正式上線!
基礎(chǔ)概念——什么是化學(xué)修飾?
序列的化學(xué)修飾是指對(duì)核酸(DNA、RNA)或蛋白質(zhì)等生物大分子結(jié)構(gòu)的改變。這些修飾涉及在序列中的特定位點(diǎn)引入化學(xué)基團(tuán)或做其他結(jié)構(gòu)變化,從而改善它們的特性或功能。例如2'-氧甲基(2'-OMe)修飾:在siRNA的核苷酸中,2'-羥基被甲基基團(tuán)取代,這種修飾可以提高siRNA的穩(wěn)定性,增強(qiáng)對(duì)RNA酶的抵抗力。類似的還有磷酸二酯(phosphorothioate)修飾、膽固醇修飾(5’-Chol,3’-Chol)等等?;瘜W(xué)修飾方式可以根據(jù)經(jīng)驗(yàn)、專利文獻(xiàn)結(jié)合具體的實(shí)驗(yàn)需求和應(yīng)用場(chǎng)景進(jìn)行選擇和組合,以提高目標(biāo)產(chǎn)品性能,改善治療效果。
為什么做序列化學(xué)修飾檢索數(shù)據(jù)庫?
隨著小核酸多肽賽道的熱度飆升,序列的設(shè)計(jì)和修飾是開發(fā)這些領(lǐng)域有效藥物的關(guān)鍵步驟,同時(shí)也是IP保護(hù)的重要策略點(diǎn)。然而,目前全球尚無數(shù)據(jù)庫能夠通過修飾類型和修飾位點(diǎn)實(shí)現(xiàn)一鍵式檢索,覆蓋所有相關(guān)序列和專利,導(dǎo)致專業(yè)人員不得不依賴耗時(shí)的關(guān)鍵詞搜索和專家篩選。
智慧芽Bio產(chǎn)研團(tuán)隊(duì)通過對(duì)國(guó)際制藥企業(yè)的深入調(diào)研揭示了一個(gè)現(xiàn)實(shí)挑戰(zhàn):在缺少高效自動(dòng)化工具的背景下,研發(fā)與IP專業(yè)人員不得不依賴初步目標(biāo)設(shè)定和手動(dòng)檢索專利信息的策略,且需頻繁更新。專利文件中對(duì)化學(xué)修飾的隱晦描述進(jìn)一步增加了這一過程的復(fù)雜性,顯著提升了侵權(quán)風(fēng)險(xiǎn)管理的難度。
調(diào)研結(jié)果凸顯了化學(xué)修飾序列檢索在以下兩大關(guān)鍵領(lǐng)域的緊迫性和重要性:
1)研發(fā)效率提升:有效的化學(xué)修飾檢索工具能夠助力研發(fā)團(tuán)隊(duì)精確識(shí)別和分析目標(biāo)蛋白的修飾狀態(tài),從而加速藥物發(fā)現(xiàn)和分子設(shè)計(jì)的過程,提升研發(fā)效率和成果的轉(zhuǎn)化潛力。
靶標(biāo)識(shí)別:對(duì)于專注于信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制的研發(fā)團(tuán)隊(duì),通過檢索具有特定化學(xué)修飾(如磷酸化)的序列,能夠精確識(shí)別并鎖定潛在的靶標(biāo)蛋白,從而加速藥物發(fā)現(xiàn)過程。
藥物優(yōu)化:研發(fā)人員通過分析不同化學(xué)修飾對(duì)分子的半衰期和穩(wěn)定性的影響,可以優(yōu)化藥物候選物的性能,以期達(dá)到更高的療效和安全性標(biāo)準(zhǔn)。
2)IP戰(zhàn)略保護(hù):對(duì)化學(xué)修飾的深入理解和快速檢索對(duì)于IP專業(yè)人員至關(guān)重要,有助于在激烈的市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)中維護(hù)其知識(shí)產(chǎn)權(quán)優(yōu)勢(shì),規(guī)避潛在的法律風(fēng)險(xiǎn)。
可專利性分析:IP團(tuán)隊(duì)通過細(xì)致梳理現(xiàn)有文獻(xiàn)和專利資料,評(píng)估特定化學(xué)修飾的新穎性。通過比較目標(biāo)修飾與已知修飾,他們能夠識(shí)別出可能支持專利申請(qǐng)的獨(dú)特特征。
FTO評(píng)估:IP專家需對(duì)現(xiàn)有知識(shí)產(chǎn)權(quán)進(jìn)行全面審查,以確定新發(fā)現(xiàn)的化學(xué)修飾是否可能侵犯他人的專利權(quán)。這包括分析特定修飾的使用情況、相關(guān)文獻(xiàn)記錄等,以確保研發(fā)活動(dòng)不會(huì)引發(fā)知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛。
推出全球首創(chuàng)功能,用戶可高效檢索序列的化學(xué)修飾
用戶以前只能按序列查看化學(xué)修飾,現(xiàn)在使用智慧芽Bio化學(xué)修飾檢索功能可直接通過化學(xué)修飾檢索序列和專利,無需再手動(dòng)整理。傳統(tǒng)費(fèi)時(shí)費(fèi)力的化學(xué)修飾檢索難題,在智慧芽Bio化學(xué)修飾檢索功能里均得到解決。
圖:Bio生物序列數(shù)據(jù)庫化學(xué)修飾檢索入口
傳統(tǒng)挑戰(zhàn)1:專利文獻(xiàn)中對(duì)序列修飾的描述缺乏統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),導(dǎo)致差異巨大。用戶在進(jìn)行關(guān)鍵詞搜索時(shí),必須手動(dòng)包含所有可能的修飾,這極易導(dǎo)致關(guān)鍵專利的遺漏。
Bio的技術(shù)突破:我們已成功為眾多序列修飾建立了標(biāo)準(zhǔn)化的檢索體系,并將持續(xù)進(jìn)行迭代優(yōu)化,以確保用戶能夠準(zhǔn)確、全面地獲取所需信息。
圖:支持標(biāo)準(zhǔn)化化學(xué)修飾體系勾選
傳統(tǒng)挑戰(zhàn)2:用戶在搜索具有相同修飾類型的序列,尤其是特定位點(diǎn)的序列時(shí),面臨極大的困難?,F(xiàn)有的工作流程復(fù)雜,通常需要結(jié)合基礎(chǔ)序列搜索和修飾類型關(guān)鍵詞搜索,采取多策略并行的方法。
Bio的技術(shù)突破:通過我們的化學(xué)修飾檢索功能,用戶可無需序列信息即可直接搜索特定修飾類型的序列,極大地簡(jiǎn)化了檢索流程,提高了檢索的精確度和效率。
圖:無序搜索更深洞察研發(fā)思路
傳統(tǒng)挑戰(zhàn)3:無法直觀顯示整個(gè)化學(xué)修飾檢索結(jié)果。單獨(dú)看每篇專利中的化學(xué)修飾可能會(huì)遺漏一些關(guān)鍵信息,比如常見的修飾類型、最優(yōu)的修飾位點(diǎn)或該領(lǐng)域的熱門研發(fā)趨勢(shì)。
Bio的技術(shù)突破:我們的列表頁"修飾總覽"可讓用戶快速識(shí)別整個(gè)數(shù)據(jù)結(jié)果中化學(xué)修飾的分布,并支持導(dǎo)出報(bào)告。
圖:"修飾總覽"一覽修飾全貌
創(chuàng)新突破背后的數(shù)據(jù)、技術(shù)及產(chǎn)品詳細(xì)展示
化學(xué)修飾數(shù)據(jù)來源
基于智慧芽數(shù)據(jù)專家團(tuán)隊(duì)人工整理67萬數(shù)據(jù),以及提取專利序列列表中的84萬化學(xué)修飾數(shù)據(jù),共計(jì)150萬修飾序列供用戶搜索查詢,打造了涵蓋9大類別、382個(gè)子類的化學(xué)修飾標(biāo)準(zhǔn)化體系。
引入全局序列比對(duì)算法
先進(jìn)的全局比對(duì)算法,適用于大部分具有顯著相似性的序列,有時(shí)會(huì)返回更好的結(jié)果,尤其適用于短序列檢索。
產(chǎn)品便捷好用
檢索界面清晰易用,功能齊全,檢索結(jié)果數(shù)據(jù)全面詳細(xì),可支持導(dǎo)出報(bào)告,可追溯命中修飾數(shù)據(jù)的來源。以下是產(chǎn)品展示。
a. 構(gòu)建檢索式
b. 檢索結(jié)果頁
c. 修飾總覽生成修飾檢索報(bào)告
d. 查看序列詳情
未來持續(xù)不斷優(yōu)化迭代
1. 提升化學(xué)修飾標(biāo)準(zhǔn)化的準(zhǔn)確性和覆蓋度,用戶可對(duì)更多的特定修飾進(jìn)行精確檢索。
2. 擴(kuò)大專利中修飾覆蓋的范圍,涵蓋表格、全文、圖片,進(jìn)一步更好地支持用戶檢索修飾序列。
3. 提升結(jié)果的可視化展示,提供直觀的數(shù)據(jù)解讀方式,清晰地識(shí)別不同數(shù)據(jù)之間的關(guān)系。
.....
小核酸多肽領(lǐng)域需要申請(qǐng)?jiān)囉眯揎棛z索的用戶
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(原標(biāo)題:行業(yè)革新!繼「通式檢索」后,全球獨(dú)家「化學(xué)修飾檢索」技術(shù)震撼登場(chǎng))
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來源:IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)
編輯:IPRdaily辛夷 校對(duì):IPRdaily縱橫君
注:原文鏈接:行業(yè)革新!繼「通式檢索」后,全球獨(dú)家「化學(xué)修飾檢索」技術(shù)震撼登場(chǎng)(點(diǎn)擊標(biāo)題查看原文)
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